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Google DeepMind发布AlphaGenome Atlas,绘制人类基因组全图谱

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Google DeepMind推出了名为AlphaGenome Atlas的AI工具,包含人类基因组中每个可能DNA字母变化的预测图谱。该平台覆盖约90亿种单字母替换的分子影响,并提供变体影响评分。研究人员可通过网页门户免费使用,有望加速疾病研究和治疗开发。

Google DeepMind近日发布了名为AlphaGenome Atlas的AI工具,其科学家声称该工具能帮助解开人类基因组的奥秘,加速科学研究,最终为疾病治疗开辟新路径。研究人员在周二发布的博客文章中表示,该平台包含“人类基因组中每个可能的DNA字母变化的预测图谱”。

DNA由四种化学“字母”书写,通常简写为A、C、G和T,人类基因组包含约30亿个字母对。单个字母的变化可能无害,也可能导致疾病,而约90亿种可能的单字母替换使得识别关键变异成为巨大挑战。Atlas提供了每种变异如何影响分子层面的预测,例如改变特定蛋白质的产量。Google称这是“基因突变如何影响分子生物学的最全面目录”。

为帮助研究人员筛选数十亿种可能性,Google还发布了名为变体影响评分(AVI)的工具,结合公司其他模型预测DNA变化的影响。研究者可同时快速排序变异并解读其分子效应。该项目建立在去年发布的AlphaGenome模型和更早的AlphaMissense工具基础上,但Atlas将预测扩展到整个基因组,包括大部分不直接编码蛋白质但控制基因行为的区域。

DeepMind基因组学负责人Ziga Avsec在新闻发布会上表示,将模型能力转化为全基因组目录耗时较长,因为空间太大。AlphaGenome使用人类和小鼠基因组的公共数据库训练,数据集规模约1拍字节。Atlas今天起通过网站供研究人员非商业使用,商业用途将在Google Cloud上“很快”开放。

原文Google’s Atlas of the human genome could pave the way for new treatmentstheverge.com

#Google DeepMind#基因组#科研突破

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